云南九九物流有限公司成立于2000年，系原昆明卷煙廠運輸科剝離社會職能而改制而成的，為云南合和（集團）股份有限公司全資企業。
主要經營業務為物流運輸、汽車修理、汽車零配件零售、潤滑油銷售、普通貨物倉儲服務、派駐業務及車輛租賃等。
公司擁有自有貨運車輛112輛，并常備應急車輛約100臺，配備兩個專用停車場，總面積超過了13000平方米。
公司汽車修理廠憑借多年的行業經驗和專業技術，已成為昆明市汽車維修行業協會會員單位、一類汽車維修企業；榮獲云南省機動車維修企業質量信譽度3A級單位稱號，主要為云南中煙及下屬單位和煙草商業公司的公務車輛提供維修服務，連續多年是煙草企業公司綜合車輛定點維修單位，并具備叉車、鏟車等特種車輛維修資質。
2018年公司被中國物流行業協會評定為3A級物流企業。2021年公司被云南省公安廳、云南省文明辦評為“云南省2020年度文明交通先進單位”。目前，公司是云南中煙高質量發展先行先試的龍頭物流企業，是唯一一家承接云南中煙“公鐵聯運”業務的物流企業。